Québec, Bas-Canada, Haut-Canada, Canada-uni. Gouverneur, secrétaire civile du : A la suite de la recommandation de la commission d'enquête sur le ministère des Indiens (la commission Bagot), 1842-1844, on a entrepris une réorganisation globale du ministère. En vertu de décrets émis en mai 1844, les activités principales du ministère des Indiens de la province du Canada ont été transférées vers la capitale, et la coordination des Affaires indiennes a été placée sous le contrôle du secrétaire civil qui a été nommé d'office surintendant général des Affaires indiennes. Par la suite, le bureau du surintendant en chef du Canada-Ouest a été aboli. On a également procédé à quelques changements de personnel au sein des organismes nationaux du ministère des Indiens dans le Canada-Ouest et le Canada-Est. Voici une liste des secrétaires civils qui étaient également surintendants généraux des Affaires indiennes entre 1844 et 1860 : J. M. Higginson, 1844-1846; G. Vardon (intérimaire), 1846-1847; major T. E. Campbell, 1847-1849; colonel R. Bruce, 1849-1854; L. Oliphant, 1854; lord Bury, 1854-1856; S. Y. Chesley (intérimaire), 1856; et R. T. Pennefather, 1856-1860. Il est vrai que la responsabilité de coordonner les Affaires indiennes dans la province incombait au secrétaire civil, mais la nature de son travail signifiait qu'il consacrait souvent son énergie ailleurs et que les opérations quotidiennes du bureau central du ministère des Indiens dépendaient surtout du commis en chef et du comptable. La coordination des Affaires indiennes est restée sous le contrôle du secrétaire civil jusqu'à ce que l'autorité britannique confie la responsabilité des Affaires indiennes à la province du Canada en 1860 (23 Victoria, Chap. 151). Par la suite, les Affaires indiennes passent sous la responsabilité du Commissaire du domaine et l'on crée une direction au sein du ministère des Terres de la Couronne dans le but d'administrer les Affaires indiennes. Le Commissaire du domaine est nommé surintendant en chef des Affaires indiennes. Afin de fournir un contexte au sujet du rôle joué par le secrétaire civil du point de vue des Indiens, dans le cadre de l'ensemble des fonctions acccomplies par le bureau, il est important de noter que le secrétaire civil s'occupait des affaires liées à l'administration civile de la province et que le secrétaire militaire s'occupait des questions de nature militaire. D'un point de vue historique, la surintendance des Affaires indiennes relevait tantôt des affaires civiles, tantôt de l'administration militaire. Les deux secrétaires du Gouverneur conservaient le courrier et les registres de courrier dans des séries séparées. Les distinctions entre les responsabilités des divers bureaux ne sont pas toujours évidentes. Le secrétaire particulier faisait partie du personnel attitré du Gouverneur tandis que le secrétaire civil faisait partie du personnel permanent de la province, mais il pouvait arriver qu'une seule personne occupe les deux postes. La continuité des opérations était assurée par les secrétaires civils et militaires qui conservaient leurs postes alors que les gouverneurs se succédaient.
