La sous-série renferme un recueil mixte d'index par sujet préparé par G. M. Matheson (archiviste registraire aux Affaires indiennes de 1898 à 1936) ainsi que par d'autres membres du personnel ministériel au début du 20e siècle afin de fournir un accès aux documents relatifs aux Indiens et aux Affaires indiennes (ceux qui se trouvaient sous la garde du Ministère et d'autres organismes) en procédant par sujet. La plupart des index par sujet sont liés aux documents du système central de gestion dans la série rouge et dans la série noire quoique certains fassent référence aux systèmes de conservation des dossiers des prédécesseurs et des successeurs.
Les index comprennent, entre autres, les suivants : index aux volumes 6762 à 6806 des dossiers relatifs à la série de la guerre et des pensions 452 (vol. 11190); index par sujet et par ordre alphabétique et références à la série rouge et à la série noire (vol. 11190); " Index and Precis of Documents, 1914-1924 ", index nominal, par sujet et par ordre alphabétique qui contient des précis sur les sujets sélectionnés et qui fait surtout référence à la série rouge et à la série noire (vol. 11190); " Mr. Stewart's Old Index Book ", index nominal, par sujet et par ordre alphabétique qui a d'abord été compilé par Samuel Stewart, l'un des premiers archivistes registraires du Ministère, mais auquel on a plus tard apporté des ajouts (vol. 11191); index nominaux, par sujet et par ordre alphabétique et références au dossier de la série rouge et de la série noire (vol. 11191 et 11398);" "Key for finding the old Indian records both in the Department and in the Archives ", index par ordre alphabétique des agents et des agences qui comprend des commentaires quant à savoir où il est possible de trouver la correspondance dans les anciens index de la série rouge et de la série noire, et quelques références aux documents établis avant la Confédération (vol. 11191); " Archives Reports ", index nominal, par sujet et par ordre alphabétique et références aux rubriques figurant dans les rapports annuels des Archives nationales du Canada, ce qui comprend une référence spéciale aux questions relatives aux Indiens (vol. 11191); " Index of Returns to the House and Answers to Questions of the Senate and House of Commons since 1897 ", index par ordre alphabétique datant d'environ 1898 à 1939 et qui se rapporte aussi au dossier de la série rouge 185723 et à ses nombreuses parties traitant des questions et des rapports d'ordre parlementaire (vol. 11191); dossiers contenant les listes des documents qui ont été transférés aux Archives nationales, les listes des registres qui se trouvaient à la bibliothèque des Affaires indiennes aux environs de 1928 à 1950, les listes des registres et des documents qu'avait la Section des recherches généalogiques et archivistiques des Affaires indiennes vers 1961 (vol. 11192); " Notes from Northern Superintendency Papers ", index partiel, par sujet et par ordre alphabétique relatif à la correspondance d'arrivée de la surintendance du Nord et dont les documents figurent maintenant dans les volumes 612 à 619 du RG 10 (vol. 11398); index des réserves indiennes et références au dossier de la série rouge et de la série noire (vol. 11397); et index des ventes des terres cédées (vol. 11398).
La sous-série contient également un index des mémorandums de M. W. A. Orr pour la période de juillet 1895 à mars 1921 (vol. 11092). W. A. Orr, qui a longtemps été commis à la Direction des terres et forêts, a préparé une série de mémorandums sur les questions touchant les terres indiennes et il est possible d'en trouver une copie dans les volumes 10021 et 10022. Il est important toutefois de prendre note que les références de pages qui sont comprises dans l'index et qui y sont décrites ne correspondent pas à la pagination des volumes 10021 et 10022. Il y a également des instruments de recherche et des notes historiques qui ont en grande partie été élaborés et mis en oeuvre par G. M. Matheson, archiviste registraire aux Affaires indiennes de 1898 à 1936. La sous-série comprend aussi un index de la correspondance antérieure à 1872 ainsi que des notes s'appliquant aux années 1872 et 1873 (vol. 766), un index des sujets importants relatifs aux registres de 1842 à 1860 (vol. 767); un index des volumes 247 à 271 de la série C, c'est-à-dire les volumes des documents militaires et navals britanniques (RG 8) qui traitent précisément des affaires indiennes (vol. 768), un index des documents de Claus, des manuscrits privés qui se trouvent ailleurs aux Archives nationales (MG 19) (vol. 768), des notes historiques sur les Affaires indiennes (vol. 768A), un index des ventes des terres aux Territoires du Nord-Ouest, qui fait référence aux ventes des terres et aux rétrocessions au Nord-Ouest en 1906 et qui fournit le nom des acheteurs, les lieux ainsi que le numéro de vente (vol. 309).
