Office of the Under-Secretary of State for External Affairs : En 1909, Sir Joseph Pope est devenu le premier sous-secrétaire d'État aux Affaires extérieures au Canada. Pendant les premières années du Ministère, M. Pope et huit membres du personnel se sont chargés de la délivrance des passeports, de préparer les documents du premier ministre et du Cabinet pour les conférences impériales, de l'accréditation de consuls étrangers, et d'entreprendre des recherches afin de produire des dépêches confidentielles sur l'immigration, le commerce, les pêcheries, les affaires en matière de défense impériale et sur tout autre sujet proposé par le premier ministre. Le Ministère a également aidé le premier ministre Borden dans la conduite tentative d'une politique étrangère indépendante à la fin de la Première Guerre mondiale.
Le 1er avril 1925, O.D. Skelton remplaça Sir Joseph en tant que sous-secrétaire. Le ministère des Affaires extérieures s'agrandit au cours des années 20, alors que le premier ministre Mackenzie King comptait de plus en plus sur les conseils de son sous-secrétaire en matière de politique sur la Société des Nations, les relations impériales et canado-américaines, les problèmes commerciaux, le nombre croissant de postes à l'étranger, la défense, le désarmement, la formulation de traités et de nombreuses questions d'ordre national. Après l'élection de R.B. Bennett comme premier ministre en 1930, M. Selton et le personnel du Ministère s'occupaient plus d'affaires commerciales que de politique internationale. Avec le retour de Mackenzie King comme premier ministre en 1935, le travail du sous-secrétaire se concentra de nouveau vers les affaires d'ordre national et international. De plus, avec l'approche de la Seconde Guerre mondiale, le Ministère devait répondre à des questions relatives à la souveraineté du Canada devant une déclaration de guerre de l'Angleterre. Le sous-secrétaire et son personnel était également occupés à préparer des réponses et à recueillir de l'information sur la détérioration de la situation en Europe, ainsi qu'à formuler les moyens par lesquels le gouvernement en général et le Ministère en particulier répondraient à une situation de guerre.
O.D. Skelton est mort soudainement le 28 janvier 1941 et fut remplacé par Norman Robertson. Pendant la Seconde Guerre mondiale, le premier ministre Mackenzie King comptait sur le Ministère pour régler la multitude de problèmes, domestiques et étrangers, auxquels le gouvernement faisait face en temps de guerre. Ces problèmes s'étendaient sur de nombreux sujets dont l'aviation civile, les conseils ou commissions conjoits avec les États-Unis et l'Angleterre, les internés civils, la censure, la sécurité et le renseignement, et la planification de l'après-guerre. Ces problèmes, ainsi que la direction générale des relations entre le Canada et l'étranger pendant la guerre, tombaient sous la responsabilité du Ministère qui continuait de s'accroître.
Après la guerre, la réputation internationale du Canada se fait connaître et le Ministère participe à presque toutes les organisations et les conférences internationales. Des sujets tels que le rôle du Canada dans l'Organisation des Nations Unies et ses nombreuses agences spécialisés, la création de l'OTAN, le rôle du Canada dans maintien de la paix en Corée et au Moyen-Orient, et les relations économiques et de défenses entre le Canada et les États-Unis faisaient tous partie des responsabilités du cabinet du sous-secrétaire. Pendant les années 50, le cabinet était non seulement responsable du processus décisionnel des affaires étrangères du Canada, mais son sous-secrétaire était également président d'innombrables comités interministériels, en plus d'être responsable des diplomates et des chefs d'État invités.